Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacnb2Q8CC27 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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