Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A430089I19RikQ8C9W1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms