Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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Atg4aQ8C9S8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Atg4aQ8C9S8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Atg4aQ8C9S8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Atg4aQ8C9S8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Atg4aQ8C9S8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Atg4aQ8C9S8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg4aQ8C9S8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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