Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms