Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ska3Q8C263 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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