Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FarsaQ8C0C7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FarsaQ8C0C7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FarsaQ8C0C7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FarsaQ8C0C7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FarsaQ8C0C7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FarsaQ8C0C7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FarsaQ8C0C7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FarsaQ8C0C7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FarsaQ8C0C7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FarsaQ8C0C7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FarsaQ8C0C7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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