Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms