Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms