Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Chd9Q8BYH8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Chd9Q8BYH8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Chd9Q8BYH8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Chd9Q8BYH8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Chd9Q8BYH8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Chd9Q8BYH8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Chd9Q8BYH8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd9Q8BYH8 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms