Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx17Q8BVL3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms