Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp43Q8BUM9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp43Q8BUM9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp43Q8BUM9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp43Q8BUM9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp43Q8BUM9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp43Q8BUM9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp43Q8BUM9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp43Q8BUM9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp43Q8BUM9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp43Q8BUM9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp43Q8BUM9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp43Q8BUM9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp43Q8BUM9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp43Q8BUM9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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