Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms