Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn3Q8BHH8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clrn3Q8BHH8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn3Q8BHH8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms