Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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