Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms