Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cracr2bQ80ZJ8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cracr2bQ80ZJ8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms