Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms