Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PhkbQ7TSH2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PhkbQ7TSH2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms