Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms