Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms