Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms