Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Eci3Q78JN3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Eci3Q78JN3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Eci3Q78JN3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Eci3Q78JN3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Eci3Q78JN3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Eci3Q78JN3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Eci3Q78JN3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Eci3Q78JN3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Eci3Q78JN3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Eci3Q78JN3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms