Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssh1Q76I79 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms