Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms