Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Topbp1Q6ZQF0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms