Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms