Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms