Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbtb39Q6PDK0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb39Q6PDK0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms