Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms