Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms