Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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