Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

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Length 1,607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Thsd7bQ6P4U0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Thsd7bQ6P4U0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Thsd7bQ6P4U0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Thsd7bQ6P4U0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Thsd7bQ6P4U0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Thsd7bQ6P4U0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Thsd7bQ6P4U0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Thsd7bQ6P4U0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd7bQ6P4U0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms