Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc4Q6P2L7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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