Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Tpm4Q6IRU2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms