Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms