Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sv2cQ69ZS6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sv2cQ69ZS6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms