Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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