Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pkp4Q68FH0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pkp4Q68FH0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pkp4Q68FH0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pkp4Q68FH0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pkp4Q68FH0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pkp4Q68FH0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pkp4Q68FH0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pkp4Q68FH0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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