Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF7

Slain1, SLAIN motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slain1Q68FF7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slain1Q68FF7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms