Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms