Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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