Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja3Q64448 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms