Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms