Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms