Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd47Q61735 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cd47Q61735 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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