Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms