Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms