Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Acvr1bQ61271 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acvr1bQ61271 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms