Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms