Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slc6a4Q60857 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Slc6a4Q60857 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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